Hiện nay nguyên nhân chính xác gây bệnh vẫn chưa được xác định. Tuy nhiên bệnh có liên quan đến nhiễm nấm, nhiễm trùng, các hóa chất gây dị ứng. Bên cạnh đó cơ địa của bệnh nhân cũng có quyết định đến khả năng mắc bệnh.
Một số nghiên cứ cho rằng bệnh tổ đỉa do dị ứng theo mùa. Vì vậy mụn rộp thường bị vỡ hơn trong mùa dị ứng như mùa xuân.