Viêm đại tràng và bệnh Crohn (một tình trạng viêm ruột khác) hoàn toàn không giống nhau.
Mức độ viêm trong viêm loét đại tràng chỉ khu trú ở đại tràng, bắt đầu từ trực tràng và kéo dài liên tục đến hết đại tràng và chỉ ảnh hưởng đến lớp niêm mạc trong cùng của đại tràng.
Trong khi đó bệnh Crohn có thể ảnh hưởng đến bất kỳ khu vực nào của đường tiêu hóa từ miệng đến hậu môn. Tính chất viêm trong bệnh Crohn là không liên tục, có thể có những đoạn viêm xen lẫn với những đoạn bình thường và mức độ viêm không chỉ ở niêm mạc như viêm đại tràng mà có thể ảnh hưởng đến toàn bộ độ dày của thành ruột.